Az 1552-es alapítás óta a Germanicumért való felelősséget a Jézus Társaságára bízták. Ennek megfelelően a kollégium vezetését a jezsuita rend általános főnökére bízzák, akit hivatalának gyakorlásában egy küldött képvisel. A küldött évente látogatást tesz a kollégiumban. A kollégium rektorának kinevezése a generális atya hatáskörébe tartozik, míg a delegátus nevezi ki a kollégiumi adminisztráció többi tagját (miniszter, ökonómus, tanulmányi prefektus), a lelkiatyát és a kollégiumban dolgozó többi jezsuitát. Jelenleg a következő jezsuiták dolgoznak a kollégiumban:
P. Gernot Wisser SJ
Rektor
P. Gernot Wisser SJ közvetlenül felelős a kollégium vezetéséért és a gazdasági igazgatásért, és meghozza az ehhez szükséges döntéseket. Ő képviseli a helyi püspököt a diák számára, és így felelősséget vállal a teljes oktatási útjáért.
1956-ban született, Bécsben nőtt fel, ott tanult építészetet, és 6 évig dolgozott ezen a területen. 1986-tól teológiát tanult Bécsben, majd Rómában a Kollégium szeminaristájaként. Pappá szentelése után belépett a jezsuita rendbe, és különböző pozíciókat töltött be Bécsben. 2008-2014 között az osztrák jezsuiták provinciálisa volt, majd egy szombati évet töltött Guatemalában, végül 6 évig plébános volt az innsbrucki egyetemi plébánián.
A kollégium rektora 2021. júliusa óta.
P. Friedrich Prassl SJ
Miniszter
P. Friedrich Prassl SJ miniszter - a jezsuitáknál szokásos módon - az úgynevezett "miniszter", aki a kollégium és a Villa San Pastore adminisztratív ügyeiért felelős. Ő a kollégiumi személyzet elöljárója és a ház vendégeinek kapcsolattartója. Mint ökonómus a főiskola kollégium és az alapítvány gazdasági irányításáért is felelős. A Santo Stefano Rotondo templom lelkipásztori gondozásáért is felelős. Prassl atya 1964-ben született Bad Radkersburgban. Turisztikai ügynökként dolgozott Lausanne-ban, Zürichben és Torontóban, mielőtt 1992-ben belépett a grazi szemináriumba, majd 1995-ben az innsbrucki jezsuita noviciátusba. Filozófiai és teológiai tanulmányai befejezése után Prassl atyát 2002-ben szentelték pappá Innsbruckban. Ezt több év követte a Collegium Canisianum alrektoraként, tanulmányi prefektusként és közgazdászként, majd Rómában a lelkiségre szakosodott tanulmányokat folytatott. 2010-től 2017-ig az Innsbrucki Nemzetközi Teológiai Kollégium Canisianum vezetője volt. Prassl atya 2018 óta a bécsi Kardinal König Haus igazgatója.
P. Elemér Vízi SJ
Spirituális
P. Elemér Vízi SJ spirituálisként a kollégium növendékeinek lelki képzéséért (elmélkedési anyagok készítése, előadások, beszélgetések, lelkigyakorlatok) és a diákok növendékek lelki vezetéséért felelős. Született 1974-ben. Filozófiai és teológiai tanulmányait a Gyulafehérvári Érsekségi Szemináriumban végezte. 1994-től 1998-ig Freiburgban tanult teológiát. 2000. június 30-án szentelte pappá Jakubinyi György érsek, FM. 2003-ban lépett be a jezsuita rendbe. 2008-tól 2016-ig a Lelkipásztori Képzés Központot vezette Dobogókőn. 2010-től egyben a Szent-Ignác Lelkiségi Központ vezetője is volt. 2017-től 2023-ig a Magyar Jezsuita Rendtartomány Provinciálisa volt.
P. Johannes Stoffers SJ
Tanulmányi prefektus
P. Johannes Stoffers SJ a Kollégium diákjainak tanulmányaiért felelős. Az ő feladata, hogy útmutatást adjon az első ciklusban a kurzusok, a második ciklusban pedig a szakirány kiválasztásához, valamint nyelvi és pasztorális kurzusokat szervezzen.
Johannes Stoffers SJ atya 1982-ben született, 2011-ben lépett be a jezsuita rendbe, mint egyházmegyés pap Paderbornban. A noviciátus után káplánként dolgozott a müncheni Szent Mihály jezsuita templomban és a müncheni filozófiai iskolában. Jelenleg a római Pápai Gergely Egyetem docense. Emellett 2022 óta a kollégium könyvtárosa.