Formacija u Pontificium Collegium Germanicum et Hungaricum orijentirana je na kontinuiranu integraciju cjelovite ljudske zrelosti, duhovnog rasta, znanstvene kompetencije i pastoralnog osposobljavanja. Važan aspekt ovog usavršavanja je akademski studij, koji bi trebao dovesti do temeljnog znanja i sažetka najvažnijih filozofskih i teoloških sadržaja i omogućiti znanstveno odgovoran oblik služenja vjeri.

Studenti CGU-a obično studiraju na Papinskom sveučilištu Gregoriana. Posebnost Gregoriane leži prije svega u činjenici da i studenti i profesori dolaze iz svih dijelova svijeta. Na taj se način može doživjeti konkretno katoličanstvo Crkve. Jezik nastave na Gregoriani je talijanski za obvezne tečajeve. Osim toga, drugi tečajevi, kao što su ispiti, mogu se održati na do šest drugih jezika.

Nakon dvogodišnjeg filozofskog osnovnog studija (koji je završen u matičnim zemljama) slijedi trogodišnji osnovni studij teologije, koji služi kao sustavni uvod u sva važna pitanja teologije i završava se bakalaureatom.. Nakon pastoralne ili đakonske godine slijedi specijalizacija. Dvije ili tri godine do licencijata sastavni su dio izobrazbe u CGU- u. Ovaj poslijediplomski studij moguć je na svim fakultetima i akademskim institucijama Gregoriane, kao i na drugim papinskim sveučilištima i rimskim Atenejima. Izbor specijalnosti ovisi o studentovoj dispoziciji i sklonosti te potrebama matične biskupije. Ovu specijalizaciju može nastaviti doktorat.